成功摧毀神無毗橋之後，匯合了水門的幾人便開始撤退。一路上有著水門這個強力打手，倒不必像來時那樣小心翼翼，有什麼敵人直接殺過去就是。很快，幾人便撤回到了木葉所控制的區域
在返回的時候，琉羽疑惑的看了一眼水門。原著中，水門接應卡卡西他們的時候，卡卡西他們正處于大批的岩隱忍者的包圍圈中。算算時間，這一次水門好像來晚了。也許是因為草隱村加入戰爭，導致前線的壓力變大了吧。
而水門也從卡卡西處得知了這一次任務的詳細情況。知道了他們在琉羽的隱遁感知下，有驚無險的潛入了神無毗橋的附近。也知道了他們在這一次任務中踫上了宇良一族的族人，水門這時才明白之前見到琉羽時的那絲異常是怎麼回事。
之前就听說了草千符堂在草之國戰線執行任務時，往往會對落入自己手中的岩隱和草隱的忍者采取殘酷的虐殺。水門擔憂的看了一眼琉羽，希望這個孩子不要被仇恨蒙蔽了雙眼。
在返回木葉大營之後，亥一就迎了上來。當看到水門肯定的眼神示意後，亥一忍不住大聲笑了起來，邊笑邊說著什麼‘大局已定’
在接下來的幾天之中，也許是因為補給被切斷，岩隱和草隱開始變得瘋狂起來。在前線接連不斷地發動著進攻，規模更是一次強過一次。面對岩隱和草隱的瘋狂進攻，木葉一時之間顯得有點不支。
面對岩隱和草隱一波強過一波的進攻，木葉內部卻開始傳出消息「岩隱村的補給線已經被水門大人帶隊毀掉了，岩隱村很快就支撐不下去了，現在不過是他們最後的瘋狂，這場戰爭的勝利一定是屬于木葉的。」
這消息一出，木葉這方的士氣大漲，頑強的擋下了岩隱和草隱的聯合進攻，草隱和岩隱的攻勢難以取得進展。
很快，因補給線被毀帶來的問題就來了。岩隱和草隱因為缺乏補給，之後發動的攻勢越來越弱，最後直至停止。
這種情況下，大野木那個老頭子也知道這場戰爭是打不下去了。不過他還不想認輸，他對當年木葉留給他的恥辱還記得清清楚楚。岩隱忍者們依舊在草之國前線與木葉保持著對峙，不肯派出使者前往木葉締結和平條約。
最終，在這場考驗雙方耐力的比拼中，木葉敗下陣來。木葉的使者在三代火影的授意下，啟程前往岩隱村尋求和平。
也不知道派出的使者究竟談了些什麼，最後岩隱忍者率先開始從草之國撤退。
戰爭的另一主角草隱村見情況有變，趕緊派出使者前往木葉求和。說什麼上一次加入與木葉的戰爭是完全被岩隱村逼迫的，草隱村的高層同樣是愛好和平的。對于自己境內因為各方戰爭造成的破壞，更是什麼也不敢提。
由于木葉此刻極端虛弱，並且還有剩下的霧隱村需要對付，木葉高層最終並未追究草隱村的責任。
最終，解決了岩隱和草隱兩方勢力之後，木葉的忍者們也開始撤離草之國
「結束了！」回頭看了一眼身後越來越遠的草之國，琉羽感慨道。
對于這個自己出生的國度，琉羽並未有什麼留戀，有的只是仇恨。只是不知道下一次是什麼時候來這里了，也不知道什麼時候自己才有報仇的機會。
湯之國、月之國、草之國，霧隱、雲隱、岩隱、草隱，自己也算是經歷了諸多大戰了。
不過這一次戰爭結束卻讓琉羽有著一絲奇異之感，無關在這一次的戰爭之中親手殺掉的那兩名仇人，而是因為她改變了原著中的軌跡救下了帶土。
可以說，火影世界的發展很有可能會因為這一次小小的變故而發生改變
不久，木葉的忍者大軍們便返回了木葉，還未走近大門，隔著老遠就看到了遠處洶涌的歡呼人群。
當波風水門率先踏入木葉大門之際，震動整個村子的歡呼聲便響起，村民們紛紛前來歡迎他們的英雄。
木葉的高層們站在迎接隊伍的最前方，看著波風水門滿臉微笑的回應著周圍的村民們，三代火影不禁露出了一絲笑意。
波風水門先後擊敗了雲隱和岩隱兩大敵人，他在村子內部的聲望已經到達了一個頂點。村里正巧又傳出三代火影有退位意向的消息，一時之間，讓波風水門繼任第四代的呼聲也越來越高。
隊伍之中的阿斯瑪等人也笑著回應向周圍為他們歡呼的村民，看著周圍的村民們滿臉自豪的樣子，琉羽也不禁露出一絲笑，這才是值得守護的村子
木葉對村內的宣傳是他們獲得了這次戰爭的勝利，而帶他們贏得這次勝利的便是木葉的黃色閃光。
殊不知，同一時間，在岩隱村內部同樣舉行著盛大的歡迎儀式。大野木在高台之上高聲宣布他們取得了這次戰爭的勝利後，下方的岩隱村村民的熱情更是被直接引爆。
但琉羽知道，木葉雖然成功逼迫岩隱村退兵，但實際上是輸掉了這一次的戰爭。這一次的合約，實際上木葉做出了巨大的讓步，岩隱村才答應簽下。因此岩隱村宣傳是他們取得了戰爭的勝利是沒錯的。不過木葉也借此達到了自己的戰略目的，說是一場勝利也沒錯。
戰爭與政治就是這樣，是不是真正的勝利，在整體的利益之下已經顯得不那麼重要。
不過志村團藏卻是顯得很不滿這一份合約的簽訂。在他看來，這哪是打了勝戰，打了勝戰還簽下這種條約和戰敗又有何異？
在一團藏為首的高層的壓力下，同時也是為了對在戰爭中犧牲的木葉忍者負責，三代火影猿飛日斬主動辭去了火影之位。
關于第四代火影的人選上，團藏提出了大蛇丸，但卻遭到了三代火影猿飛的否認。三代轉而提出自己早就選擇好的繼承人波風水門，理由是在第三次忍界大戰中出色的表現以及獲得了村民們的認可。
最終，在征得火之國大名的一致同意之後，水門順利成為了火之國木葉忍者村的第四代火影
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