五艘金門支隊的西班牙戰艦在前面的戰斗中損傷比較小，他們追著兩艘受傷的荷蘭戰艦在海面上纏斗了半個時辰終于將其俘虜。只是戰艦上的大部分荷蘭將士已經傷亡或者選擇了桃海。
隨著這兩艘戰艦的被俘，南澳島附近海域的戰斗基本結束。毛鈺隨後下令金門支隊的五艘戰艦趕往南澳島與孔有德匯合以防止劉香襲擊青龍船。
而此時的南澳島早已經開戰，由于劉香帶走了幾乎全部的主力戰船，此刻留在南澳島的海盜船全部是都是一些小船，而且沒有安裝佛郎機，當他們看到孔有德的六艘慶龍船的時候只是認為這是毛鈺派遣出來偷襲南澳島的。所以剩下的海盜船將近二十余艘還是全部迎了出來準備給這些膽大的海軍來個痛擊。
只是這些海盜認為孔有德船既然沒有遠程大炮，也不過就是船體高大一些，以前他們在海上搶劫的二號福船雖然沒有這麼大，但是跳幫戰只要足夠多的船靠近，對方一定會陷入混亂。等到足夠多的繩索跑上去，再大的船也會成為俘虜。
而這些大船的指揮者顯然沒有足夠的海戰經驗，六艘大船居然分散在很寬的海面上而不是聚攏在一起互相支援，這讓海盜船有了足夠的時間來包圍他們。
從空中俯瞰的話，六艘青龍船就像六個超級大的海龜，旁邊大量的蝦兵蟹將將它們包圍。但是很快這些蝦兵蟹將就拼命地多路而逃。
因為二十余艘海盜船上的戰斗力加起來也沒有其中任何一艘青龍船強大。當甲板上和船艙中的窗口打開露出無數的火槍的時候一些機靈的老海盜就選擇了逃跑。只是因為距離足夠近他們中的大部分人也只是在剛剛來得及做出反應就被無數的火槍和弓箭擊中。這場戰斗結束的更快，因為青龍船的任何一個露出海面的地方都有可能出現火槍，所以海盜們幾乎除了掉頭逃跑沒有任何僥幸躲藏的地方。
解決了南澳島剩下的海盜船，孔有德並沒有急于攻擊南澳島，而是北上在南澳島東北方向十里之外停留，除了防範可能突然出現的劉香船隊外，就是要接應大陳島和南日島的船隊前來，孔有德的青龍船隊雖然近戰彪悍，但是可以控制的海域有限，這些海盜的海船雖然已經被消滅，誰知道他們會不會從南澳島搬出小舢板趁機逃跑。
李守信和曾立剛今天很忙，前面的戰斗他們做好了拼死的準備，但是劉香逃得太快，他們的戰船多為福船和海滄船自然沒辦法參與長途追擊，而毛鈺事先給他們的任務也是支援和打掃戰場。只是李守信很快收到讓他率領船隊前往東面的戰艦對決場地的時候，他帶著大部分福船迅速趕到卻被現場的慘狀驚到了。顯然這里比他所在的戰場要激烈得多，光是失去動力需要馬上維修才能保證不沉船和繼續開動的船就多達十幾艘，達到了這次參戰艦船的三分之一。這其中還包括了毛鈺的旗艦舟山艦。
李守信立即投入了新的工作，從福船上派出維修人員現場開始應急。
台灣海峽南部，靠近台灣島的海面上，範佩西率領十艘受傷的戰艦瘋狂的逃竄，而緊追其後的毛錚和耿仲明絲毫不肯落下。由于雙方都是逆風航行，影響了船速，已經在海面上斗智斗勇了一天船員也處于疲勞狀態。所以以泉州艦為代表的新型戰艦的船首炮有了發揮的空間。20門重炮相當于兩艘戰艦的單側炮火水量，雖然在海面上分散，卻也嚴重干擾了範佩西船隊的航行。最後為了避免全軍覆滅，範佩西選擇了再次斷尾求生，留下兩艘戰艦與毛錚等人糾纏，其余八艘戰艦全速南下趕往熱蘭遮。
奉命留下來斷後的戰艦並沒有很好地完成他們的任務，因為毛錚的三艘船幾乎沒有任何損傷，速度、戰力不受影響，加上火炮數量的絕對優勢，和防御優勢，一開始就和敵人展開了對轟。等到耿仲明趕到將兩艘荷蘭戰艦包圍的時候，這兩艘戰艦的沉沒就無可避免。當然如果有其他的船跟過來及時維修毛錚其實還是想留下這兩艘船的。但是前面還有更大的目標加上展架上儲備的二木材也不多，只能眼睜睜地看著它們消失在海上。
只是哪怕是斷站的停止，也讓範佩西距離熱蘭遮更近了一步。當毛錚和耿仲明追上範佩西的時候，範佩西已經狼狽地進入了鹿兒港，荷蘭人在這里的炮台很快發現了範佩西和尾隨而來的敵人，于是開始準備。
毛鈺之前從何兵手中得到了熱蘭遮的布防圖，所以海軍高層都知道荷蘭人炮台的厲害，只能嘆口氣在港口外徘徊一陣然後無可奈何地沿路返回。
只是讓人以外的是他們迎頭踫上了劉香逃竄的船隊，自然是追上去一頓炮火。劉香欲哭無淚，采用斷尾求生，三十余艘精銳戰船在阻擋毛錚的時候第一時間損失了十余艘，好不容易果斷放棄南澳島前往熱蘭遮避難結果遇上了毛錚這個的殺星！毫無意外的，十幾艘落在後面的海盜船全部被擊沉。因為這里距離南澳島太遠了，毛錚不打算拖著幾艘破爛的海盜船前行。剩下的十幾艘海盜船也是被重創之後逃進了港口。
一天後，當毛錚和耿仲明來到南澳島的時候，毛鈺已經下令將南澳島圍困起來，優勢防止南澳島的海盜逃往大陸。
毛鈺之所以沒有急于攻擊南澳島就是想確認劉香是否放棄了南澳島，如果是，那他肯定是有所準備的，另外如果劉香遲遲不出現，島上海盜的抵抗心里就會下降。也可以減少不必要的傷亡。
這一次海戰算得上是除了廖羅灣海戰之外損失最慘重的，俘虜了兩艘戰艦和七艘武裝商船，損失了四艘武裝商船。舟山號和毛順的岱山號受創嚴重，其中舟山號即使經過修復也不再適合激烈的海上戰斗更加不適合做毛鈺的旗艦。將會推出海軍戰斗序列，安排在舟山訓練新兵。