人類補完計劃，奈歐斯第一次听到了這個詞。
這一次，碇唯斷開了和碇真嗣之間的心靈通訊，似乎是不想讓兒子知道這件事，轉而將這份計劃對奈歐斯全盤托出。
而有意思的是，這份計劃也涉及到了碇源堂隱瞞的東西。
很久之前，最初宇宙中存在一棵世界樹, 這棵世界樹是一切的起源。
世界樹經歷了長久的歲月之後，一分為三。化為白之月亞當，黑之月莉莉絲，在分化出這兩者之後，世界樹的樹根化為了朗基努斯之槍。
之後，莉莉絲和亞當, 分化出了其他使徒和人類。
這一切, 都來源于死海文書的記載。
同樣的, 人類補完計劃也是如此。
第二次沖擊發生的時候，人類組織S，也就是Nerv幕後的掌控者得到了死海文書，並知曉了這一切的存在，其中，書中預言類將會在未來進行「補完計劃」——其實就是將一切回歸到世界樹的狀態。
人類之所以沒有辦法合一，是因為人與人之間終究不能真正的敞開心扉，而且人類自身還有缺陷，不像使徒那樣充滿力量。「心之壁」，人心之間都隔著一道牆壁。唯有回歸最初的形態，大家都是一體，心之壁才會消除。
把所有人類的靈魂擺月兌的軀殼，回歸到一個集合體之中，摒棄人與人之間心靈的隔閡, 超月兌成為更進一步的生命。
「原來如此，人類補全計劃‧‧‧‧‧‧」
听到這里，奈歐斯本能的皺起了眉頭。
這個計劃听起來玄之又玄，但卻讓他有種莫名的既視感。
名為奇跡之星的阿柏似乎就是以類似的模式生存了下去，並因此成為了幾萬年沒有戰爭的天堂，從這一方面來看，這對于這個地球的人類似乎是個非常好的選擇。
然而，人類補完計劃與其說是阿柏，不如說更像是尹路德人。
當初在迪迦的世界中見到的宇宙人，它們共用一個大腦，以同化別的生物化為自己的同胞為目的侵略了地球。
其實細究起來，尹路德人的存在方式和阿柏的知性生命體很像，然而關鍵在于，知性生命體是阿柏本身的文明經過了長久的發展進化自然統一的結果，而尹路德人則是強迫他人與自己同化。
此刻的人類補完計劃正是如此。
這種計劃，听起來很美妙，但就這麼肆意決定整個地球人類的命運，真的可以嗎？
從某種意義上，這是決定了地球僅剩幾十億人口的生命。
雖然因為是人類自己的選擇，奈歐斯沒有理由阻止，但是，奈歐斯卻無法贊同這種思想, 肆意決定他人的命運，他不認為這是正確的選擇。
「所以, 你是為了阻止這項計劃才融入初號機的嗎？」
「嗯，S表面上是為了阻止第三次沖擊，實際上則是為了實施人類補完計劃，但是，這種「妄圖控制神」的行為是一種打開「潘多拉魔盒」的行為，而這其中，初號機起到了關鍵的作用。
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只是，如何解決EVA的同步問題讓我感到了困惑，但緊接著，我想到了解決方法——讓一個人的魂寄宿在EVA的核心當中，再讓駕駛員塔上EVA，讓兩個魂進行同步。而這個駕駛員，最好跟當中的魂有關系，而因此最佳方桉就是用魂的其子女作駕駛員。」
碇唯以平澹的語氣說出了恐怖的事實。
就這一點來看，她成功了，碇真嗣成為了最適合初號機的駕駛員。
「這就是我的打算，我研究EVA的技術，就是讓人類得到永生，永遠在宇宙中生存，留下人類在宇宙中活過的證明。不過，現在看來，有了別的希望，奈歐斯奧特曼——」
說著，碇唯抬頭看向了奈歐斯︰
「——請你，阻止這一切，好嗎？」
是的，碇唯的計劃不過是沒有辦法的辦法，而面對S這個操縱了人類社會的組織，唯一的破局之法就在奈歐斯身上。
在初號機中的碇唯，其實也見過奈歐斯戰斗的姿態。
那樣的力量，只要對方願意出手，人類補完計劃將會失敗，她是如此堅信，于是，她選擇了，向這位熒幕上的英雄求助。
然而，出乎意料的是，奈歐斯卻搖了搖頭︰
「抱歉，我做不到。」
看著碇唯臉上的驚訝神色，奈歐斯解釋道︰
「我雖然也不贊同所謂的人類補完計劃，但這終究是人類自己的選擇，之後如何發展，我是沒有資格干涉的，我所能做的，就是讓那些不屬于這個世界的存在，離開這個世界。」
「‧‧‧‧‧‧原來如此，你就像是神一樣呢。」
「不，我不是神，我只是誤入這個世界的旅客，所以，如果你相信你的兒子的話，就把所有的希望放在他的身上吧。」
「謝謝你照顧真嗣了。」
「不用謝。」
奈歐斯搖了搖頭，他清楚，碇唯這是因為之前幫助真嗣的事情。
然而，他所能做的只有這些。
「嗯。」
碇唯點了點頭，她接著轉頭看向了地面，看向了碇源堂的位置，眼中閃過了抱歉的神情。
隨即，她重新連接上了和碇真嗣的心靈感應，與自己的兒子告別。
「時間已經到了，真嗣，雖然媽媽不能看著你長大，但你記住，媽媽永遠愛著你們‧‧‧‧‧‧‧」
光芒消散，李林和碇真嗣輕輕的落在了地面上。
看到他們兩個人的降落，碇源堂的臉色回歸平穩，但眼中卻閃過了麻木。
「還是不行嗎？」
「這是她自己的意志，我無法干涉，而且‧‧‧‧‧」
說著，李林看向了初號機，說道︰
「她徹底封閉了自己。」
「原來如此，她就這麼不想見我嗎‧‧‧‧‧」
碇源堂嘆息了一聲，他的心態，此刻已經有了翻天覆地的變化，他看了看初號機，隨即又將在場的所有人掃了一遍，說道︰
「這次實驗結束了，冬月，剩下的事情交給你了。」
「嗯。」
說完，碇源堂獨自一人，走向了電梯。
碇真嗣看著自己的父親，他忽然感覺，這一刻，父親的背影變得蒼老起來。
下意識的，他跑了過去，跟上了碇源堂︰
「那個‧‧‧‧爸爸，我見到媽媽了，她很漂亮。」
「嗯。」
「她說，她永遠愛著我們。」
「嗯？」
听到這話，碇源堂身體停住了，他看向了碇真嗣︰
「真的嗎？」
「真的。」
「是嗎，那就好‧‧‧‧‧‧‧」